2025年，全国政协副主席、民进中央常务副主席朱永新率队，围绕“加快推进教育数字化”主题莅临我校调研指导。原市委书记、新区党工委书记现任浙江省副省长何中伟莅临我 校并召开座谈会，围绕“建设教育强市”主题，与集团有关负责人、教师代表等开展深入座谈。

2025年，学校锚定“导航式”教育理念，聚焦“学生立场”办学核心，通过个性化学习路径激发内生动力，构建覆盖课程、教学、评价、教师发展、数字技术、科学教育等以素养为导向的教育图谱。构建“成长导航、课堂导航、协同导航”三维导航体系，提炼育人模式的底层逻辑；高质量落实国家课程，深化课程改革，构建核心素养培育的立体矩阵；制定《关于全面推进“导航式”教育改革培育特色教育品牌的战略意见》，实施发展性评价，由分数导向转向“全人发展”素养评价；以“南海云”数字平台为中枢，实现学校数字服务、数字教学、数字评价的全面融合。学校入选省人工智能助力教育教学改革试点，《深化“导航式教育”创新现代化育人模式》荣登中国教育报。

2024年，教育部公示义务教育教学改革实验区和实验校名单，南海实验初中获评义务教育改革实验校，全国189所学校，全省6所学校。教育部办公厅关于全国中小学科学教育实验区、实验校名单的公示，南海实验学校获评全国中小学科学实验校，全国48所学校。

2023年6月，《南海实验学校五年发展纲要（2023-2027年）》发布，纲要围绕一个发展总目标，四大基本原则，四大主要任务，十大重点项目，保障机制进行未来五年发展整体部署。在总校纲要统领下，各学部、校区五年发展规划一并出台。

2020年，学校办学规模继续扩大，本部校区和长峙校区、惠民桥校区、旌旗山校区共有166个教学班，6934名在校生，543名在编教师，其中本部校区共119班，5158名学生，399名在编教师；新入学人数2156名，其中本部1496名。小学、初中、高中分别扩大至45、40、25个班，在校生人数分别为2000、1887、1013；幼儿园9班265人。长峙校区由16个班扩大到22个班，在校生803名；惠民桥校区由10个班扩大到14个班，在校生547名；旌旗山校区由5个班扩大到11班，在校生426名。班级数连续三年增加超过10个班，学生数与去年同期相比，增幅接近15%。教师年龄连续三年下降，平均年龄为38周岁。

2019年6月，南校发〔2019〕21号《南海实验学校2019中层干部选拔任用方案》明确：总校机构设置：办公室、后勤处、餐饮中心、财务处、学术委员会、课程服务中心（新增）。

2016年1月，舟山市教育局（舟教人[2016]2号）文件批复，同意将南海实验幼儿园和南海桂花城幼儿园合并，合并后幼儿园名称为南海实验幼儿园。2017年5月，学校党委会议讨论决定：重设财务处，从后勤处中分离。

2014年7月，舟山市教育局（舟教人[2014]38号）文件批复：南海实验学校总校设置的办事机构为办公室、后勤处、餐饮中心等3个内设机构。

2014年8月，南海实验学校（南校干[2014]1号）文件通知，撤销南海实验学校综合教育处、财务处。

2013年8月，南海实验学校（南校干[2013]2号）文件通知，决定撤销南海实验学校保卫处。

2010年3月，舟山市教育局[舟教计（2010）5号]文件批复同意，自2010年3月起，学校下属的五个学部分别更名为南海实验高中、南海实验初中、南海实验小学、南海实验幼儿园和南海桂花城幼儿园。更名后，南海实验学校一个法人的性质不变，在开展对外交流、教育教学等方面，五所学校代表南海实验学校各自承担相应的职责和任务。在职称评审、评先评优的名额分配上，五所学校各自对应于市属的一个独立学校，享受相应待遇；五所学校的人事和财务仍归属于南海实验学校总校领导和管理，五所学校的校长由总校提出建议人选，由市教育局任命。总校下属五个学校实行经费成本核算。

2009年4月，舟山市政府常务会议纪要[2009]4号明确规定,南海实验学校办学体制由民办转为公办，管理体制一次性调整分段逐年过渡，并原则通过市教育局《关于完善南海学校办学体制的建议方案》。由此，学校由原来的国有民办办学体制转换成了公办体制，并在6年内公民办并存。

2007年2月2日，舟山市人民政府市长常务会议[2007]1号纪要原则同意组建南海教育集团。明确新组建的南海教育集团为市直属事业单位，其管理机构与南海实验学校合署，实行两块牌子、一套班子，归市教育局管理；集团组建后，集团内各成员学校的办学体制、办学性质保持不变；原则通过南海教育集团以南海实验学校为核心，由当地的大成中学、临城中心小学、长峙中心小学、荷塘月色幼儿园等组成，形成新城义务教育、幼儿教育阶段的紧密型学校联合体。

2007年2月27日，舟山市机构编制委员会[舟编（2007）9号]文件同意成立舟山南海教育集团，与南海实验学校合署办公，实行两块牌子，一套班子，归口市教育局管理。舟山南海教育集团其成员学校舟山市定海区大成中学、舟山市定海区临城中心小学、舟山市定海区长歭中心小学分别更名为舟山南海教育集团大成中学、舟山南海教育集团新城小学、舟山南海教育集团长歭小学。同意成立舟山南海教育集团荷塘月色幼儿园，为差额拨款事业单位，核定编制15名。

2007年3月6日，南海教育集团荷塘月色幼儿园开园。

2007年3月22日，舟山市教育局（舟教计[2007]5号）文件通知，成立舟山南海教育集团，集团下辖南海实验学校、大成中学、新城小学、长峙中心和荷塘月色幼儿园。

2007年11月，根据南海实验学校（南校党[2007]10号、南校发[2007]42号）文件精神，南海实验学校餐饮中心为正科级，拟为独立设置机构。

2006年2月27日，舟山市政府下发[2006]4号专题会议纪要，要求南海实验学校改变部分体制，招收新城义务教育对象新生。

2001年2月8日，舟山市人民政府下达舟政发[2001]7号《关于同意建立南海实验学校的批复》,同意学校实行国有民办的办学体制,学校按社会力量办学方式运作,行政管理关系参照舟山中学,在满足市内需求的前提下,招生范围可面向市外招生;被调教师公办身份保持不变,有关待遇参照公办教师.

2001年3月19日,浙江省教育厅浙教基[2001]99号《浙江省教育厅关于公布准予2001年面向全省招生民办中小学名单的通知》准予南海实验学校初中、高中面向全省招生。

2001年7月，学校发文下设学校内设机构为办公室、综合教育处、后勤处、高中部、初中部、小学部和幼儿部等二处一室四学部。其中综合教育处下设外语教学中心、图书馆、体育艺术教学中心和现代教育技术中心（科学教育中心）。后勤处下设物业管理中心、餐饮中心。初中部下设教导处，小学部下设教导处。

2001年8月31日、9月1日，全体学生报到上学。时设44班共1790名学生，其中高中4班，初中17班，小学18班，幼儿4班。教职工356名，其中专任教师144名。

2000年3月27日，舟山市人民政府舟政[2000]1号文把新建南海实验学校列入市政府2000年重点工作、重点工程和实事项目。

2000年7月18日，舟山市教育局成立南海实验学校办学方案起草小组。

2000年7月31日，南海实验学校举行奠基开工仪式。